該如何設置研發支出輔助賬的問題：

建立研究開發費用明細賬，正確核算研究開發費是申請認定高新技術企業的最基本要求，實際工作中爭論的焦點是如何按研發項目建立研究開發費用明細賬問題，是在財務會計賬套中直接按研發項目建立明細賬進行核算（較為復雜，工作量相對大一些），還是在財務會計賬套之外建立輔助賬進行核算（比較簡單，工作量相對小一些），記賬報稅這一塊應當落實到位，而且各地科技部門和中介機構認識都不一致，根據《工作指引》規定，“企業應按照《企業年度研究開發費用結構明細表》設置高新技術企業認定專用研究開發費用輔助核算賬目，提供相關憑證及明細表，并按本《工作指引》要求進行核算”。

《國家稅務總局公告2015年第97號》第五條核算要求規定，企業應按照國家財務會計制度要求，對研發支出進行會計處理。研發項目立項時應設置研發支出輔助賬，由企業留存備查，年末匯總分析填報研發支出輔助賬匯總表。研發支出輔助賬、研發支出輔助賬匯總表可參照本公告所附樣式編制。

因此，《工作指引》和《國家稅務總局公告2015年第97號》都只要求設置研發支出輔助賬，沒有明確要求必須在財務會計賬套中直接設置輔助賬。以上便是設置研發支出輔助賬問題的解決方法，希望對您有所幫助。